詹姆斯·艾伦提到的船坞后面的“大淡水湖”，就是现在工厂东面的厂区和郭家甸家属居住区，而从现在的实际地貌看，船坞以东区域根本不存在淡水湖，而是连片的厂房和住宅小区，也即现今被称为郭家甸的区域。难道是詹姆斯·艾伦的叙述有误?根据笔者在此地几十年生活的见闻和资料佐证，詹姆斯·艾伦的叙述并未出错，而是现代人“改天换地”的举动使此处地貌发生了根本变化。

　　凡旅顺城区内40岁以上的人都知道郭家甸“荷花湾”这个地方。由于船坞以东区域地势低洼，每当夏季雨水较多时，从旅顺城区东部赵家沟背后的山上下来的雨水，会沿河道汇集于此，形成大小不一的水湾，当地人把这一片地带统称为“荷花湾”。上世纪80年代以后，船坞工厂东扩，荷花湾的水被修建的水道引入大海，此地逐渐被垫高。代之而起的是连片的厂房和家属区楼房。故詹姆斯·艾伦提到的“大淡水湖”的位置是位于现大连辽南船厂以东的工厂厂区和家属区一带。

　　因此，詹姆斯·艾伦所称的“大淡水湖”的屠杀场景即发生在当时船坞东侧的后来当地人所称“荷花湾”的地方，而此地的东侧即前文所述的“马家屯”，当时也被称为 “小天津”的地区。经此一劫，居住在此地的船坞工人及家属被屠戮殆尽。

　　船坞工厂外北部：繁华街巷屠杀情况

　　日本随军法律顾问有贺长雄，于1894年11月22日上午10时先于司令部人员进入市内，他看到街上的情景，颇感震惊，他在《日清战役国际法论》一书中记述道：“从市街北门入口到市中心的天后宫的道路两侧鳞次栉比，其房里屋外全是尸体。特别是胡同小巷，不踩踏积尸就难以通行。从市中心的天后宫向东拐，一直往前就是道台衙门和海军衙门并排形成的巨大建筑物，大建筑物的前面就是造船厂大门。造船厂的前面有个广场，沿广场东西走向有条长街，与这条长街形成直角的又有三条街，叫东街、中街和西街。这些街道也都堆满了死尸。”文中所述的长街为现在的长江路，东街(东新街)为现在的红光街，中街(中新街)为现在的忠诚街，西街(西新街)为现在的得胜街。

　　日本第二联队第四中队的一名二等军曹写给其父亲的信中记载：“一边是造船所等气派非凡的建筑物，而另一边则是堆积在街头巷尾的尸山，真是痛快之极至也。”(1894年12月6日《邮便报知新闻》转载)“造船所”的另一边是船坞北侧东新街等周边街道。

　　以船坞工人为主体的旅顺早期市民大多居住于城区内5条繁华大街附近，因此被屠杀的也大多是船坞的工人及家属。

　　船坞工厂内：没来得及逃出的工人惨遭屠戮

　　日本侵华军舰“浪速”号上的特派员水田荣雄在《战后的旅顺》中写道：“……再向前走几十步，那里也有一个小船坞，与可供修理水雷艇的大船坞一样中间有潮水。小船坞前面的池塘里漂浮着支那人的尸骸……尸体随波浪涌动。陆上的死尸已被宪兵抓来的人埋到郊外，但占领后不过数日，还没有来得及收拾池塘中的尸骸。”

　　英国驻烟台领事阿林格致欧格讷私函中转述斐里曼特短笺中说道：“他肯定旅顺港没有伤员，因为日本人是见人就杀……泰勒大夫在该城那条主要街道上，200码内就见到了70具尸体，船坞内更是尸堆如山，他在旅顺港时，日本人射杀了一些中国人。”(《中日战争》，第462页)

　　清朝建造旅顺港坞时，既建造了为“定远”、“镇远”等大型铁甲舰量身定制的“大石坞”(即“大坞”)，也建造了为方便修理小型鱼雷艇的“小石坞”(2008年已被拆除)，该“小石坞”即为上文提到的“小船坞”。因此，日军大肆屠杀之时，没有来得及逃出船坞的工人也在船坞厂区内惨遭屠戮。

　　日军在南对面沟的

　　焚尸用具就近取自船坞

　　1994年，旅顺口区政府对万忠墓进行迁移和重新安葬。根据大连市文物考古研究所《旅顺万忠墓迁移清理报告》(刘俊勇执笔)，墓中出土的一块长约70厘米的木头为木船的肋骨;墓中所出的铜器、铁器和铜铆钉、铜尖钉、铁尖钉等，绝大部分是木船上的器物;4块表面布满牡蛎贝壳的条石当取之海边。

　　日军大屠杀后，为掩盖其暴行，从1894年11月下旬到翌年1月中旬，日军先是对旅顺市街的被害尸体进行清理和草草掩埋，继而焚尸灭证。他们从市街里和水师营等处抓来约200个中国人和若干车辆，组成抬尸队，把同胞的尸体分抬三处焚烧，即黄金山东北麓的南对面沟、白玉山东麓的沟下和北对面沟一个当时为修船坞而建的砖窑圹子(现旅顺顺山街沟里)。嗣后将骨灰集中埋在现在的万忠墓里。其中，南对面沟与旅顺船坞南侧仅有一墙之隔(现为旅顺海军南山招待所所处的位置)。

　　笔者认为，因当时南对面沟与船坞工厂南侧毗邻，日军在船坞内以及船坞东部区域屠杀船坞工人及家属后，将尸体就近集中在南对面沟进行焚烧，焚烧时也就近从船坞内取材，其中用以作焚烧尸体支架的铁管，就是船坞工厂修船所用的材料;焚尸所用的船板、煤与焦炭也是取材于船厂;作为垒砌墓室的4块条石也应为船坞内清朝建造船坞堤坝和坞墙时所用的山东石岛红花岗岩。

　　下图为沙俄强租旅顺船坞时期所摄照片，此照片至今仍被一些历史书籍误读为旅顺火车站、俄军兵营、旅顺新市区街景等。经笔者考证，该图片的拍摄场景为船坞工厂的东南部区域，拍摄角度为由东南向西北，图片的右下角即为船坞工厂的东南方向。图片的右侧水域即为詹姆斯·艾伦所述的“大淡水湖”、当地人称之为“荷花湾”的地方，荷花湾与船坞工厂之间有一道围墙，围墙内的中部偏下的黑色区域是当时的煤场(煤场南墙外靠西即南对面沟)。清理万忠墓发现焚烧尸体所用的木炭、煤炭应就近取自这里。