2013年6月，东北某省大豆协会发布报告称，部分地区肿瘤发病集中可能与转基因大豆油有极大相关性。

　　类似“转基因危害人体、破坏生态，甚至生物武器”等言论在网络上并不鲜见。有人提出，外国人虽然种植转基因作物，但只用于出口，本国人不吃。甚至有网友猜测，我国转基因产业化是受某些利益集团推动，一些从事转基因研究的科学家还被称为“汉奸”。

　　对此，寇建平直截了当地表示，我国转基因产业化不受任何利益集团控制。他说：“我国开展转基因的安全性研究工作是由国家财政资金资助，由政府组织第三方权威机构和科学家团队进行评估，最后经政府批准发放安全证书和品种审定证书，能否产业化由中央政府决定。”

　　寇建平表示，我国政府在转基因生物安全管理方面建立了完善的法律法规，成立了国务院部际联席会议，组建了由各部门各领域专家组成的农业转基因生物安全委员会，认证了权威科学的第三方检测机构，能够充分保障我国的转基因安全管理和产业化决策公平公正，能够有力维护国家和公众的利益。

　　针对西方国家对转基因食品是不是“零容忍”，吴孔明表示，美国是转基因食品生产和应用大国，美国种植的80%的玉米和60%的大豆用于本国消费。欧盟是转基因产品进口和食用较多的地区，每年进口玉米400万吨，大豆3300万吨左右，进口产品中大多含转基因成分。2011年，6个欧洲国家被批准种植转基因抗虫玉米。